Marcillé-Raoul présente un territoire en pente générale vers le nord-est. Les points les plus élevés se situent près de ses limites sud-ouest, tandis que les plus bas se trouvent au nord-est, dans la vallée du Ruisseau du Val. Le bourg occupe une position centrale et septentrionale. La partie méridionale conserve des bois, dont le Bois de Beau Séjour, qui est une extension de la forêt de Bourgouët située sur la commune voisine de Dingé, et le Bois de la Claie. Plusieurs lieux-dits de cette zone portent le nom de "landes". Le territoire est drainé par plusieurs petits cours d'eau, affluents du Couesnon, qui s'écoulent vers le nord ou le nord-est.
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