Auneau est une ancienne commune intégrée depuis 2016 à une commune nouvelle. Elle se trouve sur la rive gauche de l'Aunay, une rivière qui prend sa source sur le territoire voisin d'Aunay-sous-Auneau et qui rejoint la Voise plus au nord-ouest, près d'Oinville et de Levainville. La localité possède une gare SNCF en activité sur la ligne Paris-Austerlitz via Brétigny vers Tours. Historiquement, elle était aussi desservie par une autre gare, dite Auneau-Ville, aujourd'hui fermée, qui était un nœud pour les lignes vers Chartres et vers Dreux.
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